Archive for the Microscopie Category

Alge verzi – 20 Februarie 2013

Posted in Microscopie on February 21, 2013 by maxpho

Si inca putina “joaca” cu microscopul “de servici”.

De aceasta data am ales un subiect ceva mai “comun”. Ceva ce “salasuieste” prin apa de plante: o alga verde din genul Chlorella. Mediul din care a fost “extrasa” specia in cauza a fost apa dintr-un simplu pahar cu o si mai simpla planta, ornament de prin biroul de servici.

Ca fapt divers (si aparent comic) aceste alge sunt o posibila viitoare sursa de hrana ! Probabil cand toti porcii si puii de gaina or sa fie doar fosile, nepotii nostrii or sa se gandeasca “cum omorau si mancau oare stramosii nostrii animalele alea, cand din algele verzi de apa scoatem toate proteinele de care avem nevoie..?”. Dar pana atunci, tot mai buna-i carnea :).

Alga de fata fotografiata este o Clorofita.

Pentru imaginile de mai jos am folosit atat tehnica iluminarii prin transmisie cu camp luminos (C.L.) cat si fluorescenta cu tot cu ajutorul Naturii prin Autofluorescenta.

Procesarea imaginilor cat si suprapunerea lor pentru compunerea informatiilor din lumina transmisa cu cea din fluorescenta au fost realizate in Photoshop CS2.

Subiectii au fost doi “ciorchini” (mini-colonii) de Chlorella:

green algae

alga 1

alga 2

alga 3

Si daca am inceput sa stapanesc cat de cat tehnica procesarii imaginilor combinate transmisie+florescenta (sau asa zic eu…), atunci urmatorul subiect trebuie sa fie si mai interesant si eventual mai plin de detalii interesante!

Max

(20 Februarie 2013)

First Light – Olympus BX 51 – 16 Februarie 2013

Posted in Experimente, Microscopie, Supermacrofotografie on February 17, 2013 by maxpho

Desi nu e un “obiect” personal, pot sa spun ca am “la indemana” de acum un instrument foarte performant intr-ale microscopiei. Din pacate doar la servici…

Este vorba de un microscop optic Olympus BX 51 dotat cu o camera Olympus DP72  de 12.8 Mp (cu tehnica “pixel shifting”, despre ea, mai multe informatii aici si aici).

Detalii despre aceasta “bijuterie a microscopiei” se gasesc aici, aici si aici.

Cum nu sunt chiar la inceput de drum intr-ale microscopiei, am vrut in “prima ora de acomodare” cu BX 51 sa vad de ce e in stare, in special intr-ale rezolutiei.

Am ales pentru asta solzi de fluture (ce altceva ? 🙂 ) apartinand speciei Araschnia levana f. prorsa.

Am utilizat mai mult metodele de imagistica in camp luminos in transmisie, reflexie, si doar putin in fluorescenta.

Momentan nu pun scala pe imagini, urmand sa updatez postul de fata cu detalii suplimentare dupa o a doua sesiune.

Incep cu o imagine a mai multor solzi inlaturati de pe aripa fluturelui si amplasati direct pe lamela microscopului, utilizand obiectivul de 10x. Imaginea din stanga este realizata din suprapunerea unei imagini in camp luminos prin transmisie cu una prin reflexie si polarizare, ambele fiind cate un stack din 4-5 cadre in plane diferite de focalizare (suprapunere realizata cu Zerene Stacker). Imaginea din dreapta este negativul celei din stanga, pentru un mai bun contrast.

10x

O alta imagine realizata doar prin transmisie in CL (Camp Luminos) cu obiectivul de 20x, al aceluiasi tip de solzi (tot specia Araschnia) insa in pozitia “naturala” fixati pe aripa fluturelui. Imginea este un stack din 10 cadre. Se observa detalii foarte fine cum ar fi “nervurile” longitudinale ale solzilor.

20x

Mergand “mai in detaliu” cu obiectivul de 50x…trei imagini prezentand un singur solz (prezent si in centrul primei imagini de mai sus). Prima este o suprapunere a trei imagini, cea in lumina transmisa, una in lumina reflectata (cu polarizare) si una in fluorescenta. Cea de a doua este negativul primei, pentru un contrast mai bun. Ultima este imaginea in lumina transmisa. Se observa diferentele de detalii dintre metode, cat si detaliile foarte fine dintre nervurile longitudinale surprinse doar prin transmisie.

la 50x

Si mergand chiar mai departe, cu obiectivul 100x (marirea maxima), doua imagini alb-negru (stanga-transmisa CL negativ, dreapta-reflectata (polarizare) + fluorescenta), fiecare un stack a cate 10 imagini individuale, prezentand acelsi solz cu detalii foarte fine corespunzatoare fiecarei metode de iluminare.

la 100x an

Si o animatie din cele doua imagini, cu cea realizata prin reflexie/polarizare de aceasta data in culori exagereate:

anim 100x

Toate imaginile au fost achizitionate cu softul camerei, iar procesarea am realizat-o cu Zerene Stacker si Photoshop CS2.

Max

(16 februarie 2013)

UPDATE (17 Februarie 2013):

Revin acum si cu imagini relevante pentru rezolutia atinsa in imaginile de mai sus.

Pe urmatoarele imagini am “lipit” si scala pentru a avea o idee de detaliile surprinse si de dimensiunea generala a solzilor fluturilor.

Incep cu o comparatie intre o imagine realizata prin transmisie-camp luminos (stanga) si una prin reflexie cu polarizare (dreapta).

comp 2

Si o comparatie intre cele trei tipuri de iluminari utilizate: transmisie CL, reflexie cu PL si fluorescenta:

comp

O imagine in fluorescenta in care se observa prinderea solzilor pe nervurile aripii:

solzi c

Si acum cate ceva despre rezolutia atinsa. In colajul de mai jos sunt prezentate trei imagini ale unui solz realizate cu trei obiective diferite: 10x, 50x si 100x.

marire b

Pentru evidentierea celor mai mici detalii, imaginea a treia de mai sus este amplasata langa un crop 100% din imaginea originala. Tinand cont de scara, cele mai mici detalii observabile sunt de ordinul a 0.26-0.3 (medie 0.28) microni, ceea ce corespunde perfect cu limita teoretica a obiectivului utilizat.

detaliu

Max

Microscopie – 2006 (old stuff)

Posted in Microscopie on February 10, 2012 by maxpho

Da, in postul asta o sa postez cateva imagini tocmai din 2006, cand in perioada masteratului am “primit” cu imprumut un microscop Microfot D 16 ROW (made in DDR parca) cu obiective Carl Zeiss. Trebuia sa ii curat piesele optice si sa ii repar partea mecanica. Insa nu m-am grabit prea tare ;). Am zis sa ma joc putin cu el.

Imaginile de mai jos le-am “regasit” pe un CD vechi, impreuna cu multe filme din aceeasi perioada; filme cu parameci, alge si alte microorganisme. O sa postez si filmele cand o sa le “retusez”.

Setup-ul pe care il foloseam pe atunci era compus pe langa microscopul mai sus mentionat, dintr-un bec “economic” de 20W, o camera web Philips To U cam 740k (pe care o foloseam si la astrofotografie planetara si lunara) si o lentila pozitiva amplasata in fata camerei pentru a micsora grosismrntul. Pentru captura, procesare si post-procesare foloseam pe atunci softurile: Selene, Registax 3 si Photoshop 7.

Marea parte dintre organismele din imaginile de mai jos au fost “ridicate” din apa Lacului Herastrau.

Dar sa incep:

Una dintre “very first”-urile imagini de microscopie – o retea de difractie prin transmisie, gasita prin laboratorul (de fizica a laserilor) de unde aveam si microscopul. Pasul retelei e de doar 24 microni, deci spatiul dintre doua benzi negre (trasaturi) este de 24 microni. Imaginile cu reteaua le-am folosit apoi ca etalon pentru imaginile cu microorganisme.

Si primele organisme microscopice fotografiate, apartinand Ciliatelor; se observa in imaginea a treia si cilii (cu rol in deplasare) de unde si numele clasei:

Desi echipamentul folosit era unul modest, optica de buna calitate a facut ca detaliile sa se apropie de limita de difractie in lumina vizibila (aprox 1 micron), astfel ca in cateva din imagini se observa fenomenul de difractie pe diverse componente fizice ale “animalelor”.

O imagine a unei alge la o marire extrema (mult prea mare de altfel):

Alta alga microscopica (din specia Navicula) cu detalii la limita difractiei:

Si un organism din clasa Ciliate cu “piciorusele” vizibile (unul dintre cele mai mici organisme fotografiate):

Un organism mai mare, asemanator unui crab cu tot cu carapace (nu l-am identificat):

Si un alt organism, “ceva” mai mare, un acarian, fotografiat prin doua metode diferite de iluminare (camp luminos si intunecat), si cu detalii ale picioarelor anterioare:

Urmatorul subiect: o alga de o lungime considerabila (printre alte alge asemanatoare) de 450 microni (0.45 mm) !

In continuare, cateva colaje cu imagini ale unor ciliate, alge si alte organisme colectate din acelsi (frumos candva) Parc Herastrau. In primul colaj, in imaginea a treia de pe primul rand, se observa un radiolar, cu tot cu cilii care au aproximativ 1 micron in grosime.

Un colaj cu cateva specii de microalge, fotografiate prin doua metode diferite de iluminare pentru a evidentia anumite detalii (in camp intunecat se observa mai bine detaliile “fine”, pe cand in camp luminos cele structurale si evident culorile):

Un ultim colaj pentru postul asta: o amiba (Proteus) in deplasarea sa la o viteza…peste limita rabdarii 🙂

Am avut o experienta frumoasa folosind acel microscop de calitate optica deosebita.

A trebuit sa-l returnez pana la urma…Acum cred ca sta plin de praf pe raftul de unde mi-a fost dat…Ca multe alte chestii ramase cica “in urma”.

Momentan lucrez la perfectionarea altui sistem de microscopie, si poate or sa fie si ceva imagini noi in curand pe aici. Poate.

 

Max

10 februarie 2012

Viata intr-o picatura de apa – 20 ianuarie 2012

Posted in Microscopie on January 22, 2012 by maxpho

Recent m-am hotarat sa mai dau praful de pe microscopul pe care mi l-am cumparat acum…4-5 ani cred, la mana a doua. Un microscop Made in Romania la I.O.R.

Cum intre timp am mai achizitionat/capatat cateva obiective de microscop mai bune, am zis ca ar fi vremea sa le si testez.

Am aranjat rapid un setup de micro-fotografie, cu camera astronomica DBK 41 AU02.AS, si un bec economic Philips, si am analizat apa dintr-un vas in care sotia isi tinea un “arbore de cauciuc”.

Fantasic cat de multa…viata am gasit intr-o singura picatura. Practic culoarea verzuie a apei se datora numai microorganismelor prezente: protozoare (neidentificate).

Cum setup-ul nu este inca final, pot sa spun ca imaginea de mai jos e doar orientativa, si e utila doar cantitativ in ceea ce priveste speciile observate. Obiectivul folosit a fost un 40x, iar iluminarea prin transmisie cu camp luminos. Nu am calculat inca nici rezolutia efectiva, deci nici campul observat, insa “fiintele” nu sunt mai mari de 20 microni ! (asta sigur).

Imaginea de mai sus este doar un cadru procesat dintr-un film pe care se merita sa il vizualizati AICI. In film se observa clar miscarea aparent haotica a microorganismelor. Filmul este redat la o viteza de 4x cea originala.

Max

(22 ianuarie 2012)